Metabolome

La Plateforme Métabolome de Bordeaux fédère les outils et les savoir-faire pour l’étude du métabolome, du lipidome et la mesure de flux métaboliques.

Elle est principalement dédiée à l’étude des plantes et de leurs produits dérivés.

Elle accueille chaque année environ 100 projets pour une cinquantaine d'équipes différentes.

Elle a développé :

  • la base de connaissances MeRy-B pour le stockage et la visualisation de profils métabolomiques RMN de plantes,
  • l'outil interactif NMRProcFlow pour le traitement de spectres RMN-1D,
  • l'application web BioStatFlow pour l'analyse des données.

Elle participe au développement du langage nmrML pour faciliter le partage et la réutilisation des spectres RMN.

Elle coordonne l'Infrastructure Nationale MetaboHUB, et participe à l'Infrastructure de Recherche EPPN2020 financée par le programme européen H2020.

Elle encourage la diffusion des données et propose une assistance pour leur soumission dans des dépôts de référence (e.g. MetaboLights, INRA-Dataverse)

 

Activité PMB